Kegiatan upacara bendera dilaksanakan secara rutin setiap hari Senin di SMPN 1 Bungatan. Upacara diikuti oleh seluruh siswa dan siswi, serta seluruh guru dan tenaga kependidikan (TU) dengan penuh tertib dan disiplin.
Kegiatan diawali dengan persiapan peserta upacara dan pengaturan barisan oleh petugas. Selanjutnya, upacara dilaksanakan dengan rangkaian kegiatan meliputi pengibaran Bendera Merah Putih, pembacaan Pancasila, pembacaan Pembukaan UUD 1945, menyanyikan lagu kebangsaan Indonesia Raya dan lagu nasional, amanat pembina upacara, doa, serta diakhiri dengan penghormatan kepada pembina upacara dan pembubaran barisan.
Melalui kegiatan upacara rutin setiap hari Senin, sekolah berupaya menanamkan nilai-nilai kedisiplinan, tanggung jawab, nasionalisme, cinta tanah air, serta membentuk karakter siswa yang berakhlak dan memiliki rasa kebersamaan. Selain itu, upacara menjadi sarana penyampaian informasi dan arahan dari pihak sekolah kepada seluruh warga sekolah agar kegiatan pembelajaran dan kehidupan sekolah dapat berjalan dengan baik.
Dengan dilaksanakannya upacara secara rutin, diharapkan seluruh warga SMPN 1 Bungatan dapat mengikuti kegiatan dengan penuh kesadaran, tertib, dan bertanggung jawab serta menerapkan nilai-nilai yang diperoleh dalam kehidupan sehari-hari.